Vsebina
- Splošne značilnosti DNK
- Splošne značilnosti RNA
- Dušikove baze
- Prepisovanje in prevajanje
- Od pramenov DNK do kromosomov
- Nukleinske kisline in nastanek življenja
- Medicinske terapije
Pomembne nukleinske kisline v naravi vključujejo deoksiribonukleinska kislina ali DNK in ribonukleinska kislina ali RNA. Kisline se imenujejo, ker so dajalci protona (t.j. vodikovega atoma) in zato nosijo negativen naboj.
Kemično sta DNK in RNA polimera, kar pomeni, da sta sestavljena iz ponavljajočih se enot, ki jih je pogosto zelo veliko. Te enote se imenujejo nukleotidi. Vsi nukleotidi pa vključujejo tri različne kemične dele: pentozni sladkor, fosfatno skupino in dušikovo bazo.
DNK se razlikuje od RNK na tri primarne načine. Eno je, da je sladkor, ki tvori strukturno "hrbtenico" molekule nukleinske kisline, deoksiriboza, medtem ko je v RNK riboza. Če ste sploh seznanjeni s kemijsko nomenklaturo, boste prepoznali, da je to majhna razlika v celotni strukturni shemi; riboza ima štiri hidroksilne (-OH) skupine, deoksiriboza pa tri.
Druga razlika je v tem, da je ena od štirih dušikovih baz, ki jih najdemo v DNK, timin, ustrezna baza v RNA je uracil. Dušične baze nukleinskih kislin narekujejo končne značilnosti teh molekul, ker se dele fosfata in sladkorja ne razlikujejo znotraj molekul iste vrste ali med njimi.
Končno je DNK dvoveren, kar pomeni, da je sestavljen iz dveh dolgih verig nukleotidov, kemično povezanih z dvema dušikovima bazama. DNK je navit v "dvojno vijačnico" oblike, kot prožna lestev, zasukana v nasprotnih smereh na obeh koncih.
Splošne značilnosti DNK
Deoksiribozo sestavljajo pet-atomski obroč, štirje ogljiki in kisik, ki so v bejzbolu oblikovani kot pentagon ali morda domača plošča. Ker ogljik tvori štiri vezi in dva kisika, to na štirih ogljikovih atomih ostaja osem vezavnih mest, dva na ogljik, eno zgoraj in eno pod obročem. Tri od teh pik zasedajo hidroksilne (-OH) skupine, pet pa jih vodikovi atomi.
Ta molekula sladkorja se lahko veže na eno od štirih dušikovih baz: adenin, citozin, gvanin in timin. Adenin (A) in gvanin (G) sta purin, citozin (C) in timin (T) pa pirimidini. Purini so večje molekule kot pirimidini; ker sta dva sklopa katere koli celotne molekule DNK na sredini vezana s svojimi dušikovimi bazami, se morata ti vezi tvoriti med enim purinom in enim pirimidinom, da bo skupna velikost obeh baz v molekuli približno konstantna. (Pri branju pomaga sklicevati se na kateri koli diagram nukleinskih kislin, na primer tiste v Reference.) A se zgodi, da se A veže izključno na T v DNK, C pa izključno na G.
Deoksiriboza, vezana na dušikovo bazo, se imenuje a nukleozid. Ko dodamo fosfatno skupino deoksiribozi na ogljiku na dveh mestih stran od mesta, kjer je pritrjena baza, nastane popoln nukleotid. Posebnosti elektrokemičnih nabojev na različnih atomih v nukleotidih so odgovorne za dvoverižno DNK, ki naravno tvori spiralno obliko, in dva sklopa DNA v molekuli se imenujeta komplementarne pramene.
Splošne značilnosti RNA
Pentozni sladkor v RNK je riboza in ne deoksiriboza. Riboza je identična deoksiribozi, le da je obročna struktura vezana na štiri hidroksilne (-OH) skupine in štiri vodikove atome, namesto na tri in pet. Ribozni del nukleotida je vezan na fosfatno skupino in dušikovo bazo, kot pri DNK, z izmeničnimi fosfati in sladkorji, ki tvorijo hrbtenico RNA. Baze, kot je navedeno zgoraj, vključujejo A, C in G, toda drugi pirimidin v RNA je uracil (U) in ne T.
Medtem ko DNK zadeva samo shranjevanje informacij (gen je preprosto niz DNK, ki kodira en sam protein), različne vrste RNA prevzamejo različne funkcije. Messenger RNA ali mRNA je narejena iz DNK, ko se običajno dvoverižna DNK razdeli na dva enojna sklopa zaradi prepisovanja. Nastala mRNA se končno poda proti delom celic, kjer pride do proizvodnje beljakovin, pri čemer ima navodila za ta postopek, ki ga posreduje DNK. Druga vrsta RNA, prenosna RNA (tRNA), sodeluje pri proizvodnji beljakovin. To se dogaja na celičnih organelah, imenovanih ribosomi, sami ribosomi pa so sestavljeni predvsem iz tretje vrste RNK, imenovane, primerno, ribosomske RNA (rRNA).
Dušikove baze
Pet dušikovih baz - adenin (A), citozin (C), gvanin (G) in timin (T) v DNK ter prvi trije plus uracil (U) v RNK - so dele nukleinskih kislin, ki so na koncu odgovorne za raznolikost genskih izdelkov med živimi bitji. Odseki sladkorja in fosfata sta bistvenega pomena, saj zagotavljata strukturo in gradbeno ogrodje, vendar pa so podlage tam, kjer nastajajo kode. Če svoj prenosni računalnik mislite kot nukleinsko kislino ali vsaj niz nukleotidov, je strojna oprema (npr. Diskovni pogoni, zaslon monitorja, mikroprocesor) analogna sladkorjem in fosfatom, medtem ko sta ne glede na programsko opremo in aplikacije podobni dušikove podlage, ker edinstven izbor programov, ki ste jih naložili v vaš sistem, učinkovito naredi vaš računalnik "edinstven" organizem.
Kot je bilo opisano prej, se dušikove baze razvrstijo bodisi v purine (A in G) bodisi v pirimidine (C, T in U). Vedno par v verigi DNK s T in C vedno par z G. Pomembno je, če se veriga DNA uporablja kot predloga za sintezo RNA (transkripcija), na vsaki točki vzdolž rastoče molekule RNA, ustvarjen nukleotid RNA iz nukleotida "nadrejenega" DNK vključuje bazo, ki je tista, na katero se matična baza vedno veže. To bomo preučili v nadaljnjem razdelku.
Purine sestavljajo šestčlanski obroč dušika in ogljika ter petčlanski obroč dušika in ogljika, kot šesterokotnik in peterokotnik, ki imata stran. S sintezo purina gre za kemično čiščenje sladkorja riboze, čemur sledi dodajanje amino (-NH)2) skupine. Pirimidini imajo tudi šestčlanski obroč dušika in ogljika, kot purini, vendar nimajo petčlanskega dušikovega in ogljikovega obroča purinov. Torej imajo purini večjo molekulsko maso kot pirimidini.
Sinteza nukleotidov, ki vsebujejo pirimidine, in sinteza nukleotidov, ki vsebujejo purine, potekajo v nasprotnem vrstnem redu v enem ključnem koraku. V pirimidine se osnovni del najprej sestavi, preostanek molekule pa kasneje spremeni v nukleotid. V purinih se del, ki na koncu postane adenin ali gvanin, spremeni proti koncu nastajanja nukleotidov.
Prepisovanje in prevajanje
Transkripcija je ustvarjanje niza mRNA iz predloge DNK, ki ima enaka navodila (tj. Gensko kodo) za izdelavo določenega proteina kot predloga. Postopek poteka v celičnem jedru, kjer se nahaja DNK.Ko se dvoverižna molekula DNK loči na enojne niti in transkripcija nadaljuje, je mRNA, ki nastane iz enega niza "nepečatenega" para DNK, enaka DNK drugega sklopa nezaprte DNK, le da mRNA vsebuje U namesto T. (Ponovno je sklicevanje na diagram koristno; glejte Reference.) MRNA, ko je popolna, zapusti jedro skozi pore v jedrski membrani. Ko mRNA zapusti jedro, se pritrdi na ribosom.
Encimi se nato pritrdijo na ribosomalni kompleks in pomagajo pri procesu prevajanja. Prevod je pretvorba mRNAs navodila v beljakovine. To se zgodi, ko aminokisline, podenote proteinov, nastanejo iz treh nukleotidnih "kodonov" na niti mRNA. Proces vključuje tudi rRNA (ker prevajanje poteka na rebrah) in tRNA (ki pomaga sestaviti aminokisline).
Od pramenov DNK do kromosomov
Strupe DNK se sestavljajo v dvojno vijačnico zaradi sotočja povezanih dejavnikov. Ena izmed teh so vodikove vezi, ki naravno prihajajo na svoje mesto v različnih delih molekule. Ko se vijačnica oblikuje, so vezni pari dušikovih baz pravokotni na os dvojne vijačnice kot celote. Vsak polni korak vključuje skupno približno 10 parov, vezanih na bazo. Kar bi lahko imenovali "strani" DNK, ko so bile postavljene kot "lestev", se zdaj imenujejo "verige" dvojne vijačnice. Ti so skoraj v celoti sestavljeni iz dela nukleotidov riboze in fosfata, baze pa so v notranjosti. Za vijačnico naj bi imeli tako večje kot manjše utore, ki določajo njeno končno stabilno obliko.
Čeprav lahko kromosome opišemo kot zelo dolge verige DNK, je to velika poenostavitev. Res je, da bi lahko določen kromosom v teoriji odkril eno samo neprekinjeno molekulo DNK, vendar to ne navaja zapletenega kopičenja, zvijanja in združevanja, ki ga DNK na poti tvori kromosom. En kromosom ima na milijone parov baz DNK, in če bi celotno DNK raztegnili, ne da bi razbili vijačnico, bi se njegova dolžina razširila z nekaj milimetrov na več kot centimeter. V resnici je DNK veliko bolj zgoščen. Beljakovine, imenovane histoni, tvorijo iz štirih parov podenote beljakovin (skupno osem podenot). Ta oktamer služi kot sorta za dvojno vijačnico DNA, ki se ovije dvakrat, kot nit. To strukturo, oktamer in DNK, ovito okoli njega, imenujemo nukleosom. Ko se kromosom delno odvije v pramen, imenovan kromatid, se ti nukleozomi pojavijo na mikroskopiji in so kroglice na vrvici. Toda nad nivojem nukleozomov pride do nadaljnjega stiskanja genskega materiala, čeprav natančen mehanizem še vedno ne obstaja.
Nukleinske kisline in nastanek življenja
Upoštevajo se DNK, RNA in beljakovine biopolimeri ker gre za ponavljajoče sekvence informacij in aminokislin, ki so povezane z živimi bitji ("bio" pomeni "življenje"). Molekularni biologi danes priznavajo, da sta DNK in RNA v določeni obliki pred nastankom življenja na Zemlji, a od leta 2018 nihče ni našel poti od zgodnjih biopolimerov do preprostih živih bitij. Nekateri so teoretirali, da je bila RNA v neki obliki prvotni vir vseh teh stvari, vključno z DNK. To je "hipoteza sveta RNA." Vendar to predstavlja nekakšen scenarij za piščanca in jajca za biologe, ker dovolj velike molekule RNA na videz ne bi mogle nastati drugače kot s prepisovanjem. Vsekakor znanstveniki z vedno večjo vnemo preiskujejo RNA kot tarčo prve samoponovljive molekule.
Medicinske terapije
Kemikalije, ki posnemajo sestavine nukleinskih kislin, se danes uporabljajo kot zdravila, nadaljnji razvoj na tem področju pa še poteka. Na primer, rahlo spremenjena oblika uracila, 5-fluorouracila (5-FU) se že desetletja uporablja za zdravljenje karcinoma debelega črevesa. To naredi tako, da imitira resnično dušikovo bazo dovolj natančno, da se lahko vstavi v novo proizvedeno DNK. To na koncu privede do prekinitve sinteze beljakovin.
Imitatorji nukleozidov (ki se lahko spomnite, da je sladkor riboze in dušikova baza) so bili uporabljeni v protibakterijskih in protivirusnih terapijah. Včasih je osnovni del nukleozida tisti, ki se spremeni, v drugih primerih pa zdravilo cilja sladkorni delež.