Vsebina
Eden od klasičnih načinov za določitev koncentracije mikrobov v vzorcu je redčenje vzorca, gojenje mikrobov na ploščah in štetje kolonij. Preplavljeni mikrobi rastejo iz enote, ki tvori kolonijo, sestavljene iz ene ali več celic, v vidno kolonijo, ki jo je mogoče videti in prešteti. Bakterije so najpogostejši mikrobi za oceno števila plošč. Število kolonij se uporablja za odkrivanje in štetje mikrobov v tleh, vodi in hrani. Protokoli za štetje kolonij poudarjajo natančen in metodičen pristop.
Redčenje vzorcev, posoda in inkubacija
Če vzorec mikrobov preprosto razmažete na agar ploščo, boste videli toliko enot, ki tvorijo kolonije, da se bodo posamezne kolonije zlile skupaj, zato jih ni mogoče šteti. Če želite rešiti to težavo, zmešajte vzorec v tekoč medij, vzemite majhno količino te mešanice in jo še dodatno razredčite. Postopek ponovite šest do 10-krat. Končno razredčitev razporedite na ploščo z agarji in jo inkubirajte štiri do sedem dni, preden preštejete kolonije.
Ročno štetje
Glavni trik pri štetju kolonij je prešteti vsako kolonijo piko enkrat. Eden od načinov je postavitev Petrijeve plošče na mrežno ozadje in štetje kolonij v vsaki mrežni celici, ki se gibljejo po metodičnem vzorcu skozi vse celice. Označevanje štetih kolonij na hrbtni strani Petrijeve krožnice je lahko tudi koristen pristop. Na splošno boste morali prešteti vsaj tri plošče; Za robustne sklepe uporabljajte le plošče, ki vsebujejo 30 do 300 kolonij, predlaga Microbiology Network, podjetje, ki svetovalnim laboratorijem in proizvajalcem ponuja svetovalne storitve. Plošče z kolonijami, ki so preštete za štetje ali imajo premalo kolonij, je treba znova razredčiti iz novega redčenja.
Avtomatsko štetje
Človeška napaka povečuje čas ročnega štetja kolonij. Če želite izboljšati natančnost in učinkovitost, postavite Petrijevo posodo v avtomatizirano napravo za štetje kolonij. Avtomatski števci kolonij slikajo posodo, ločijo kolonije od ozadja in nato uporabijo algoritem za štetje kolonij na plošči. Algoritmi imajo lahko težave pri razlikovanju kolonij, ko se dve ali več kolonij dotikata na robovih, tako da je to področje nenehnega razvoja programske opreme.
Še bolj zapleteno štetje
Natančnost izračuna gostote mikrobov iz števila kolonij ima nekatere omejitve. Enote, ki tvorijo kolonijo, so lahko ena sama celica, veriga celic ali cel kup celic. Predpostavka je, da kolonija predstavlja eno celico, zato so lahko koncentracije, izračunane iz števila kolonij, nizke. Različni mikrobi potrebujejo različne pogoje rasti in kolonije na plošči predstavljajo le tiste mikrobe, ki uspevajo na tem rastnem mediju pod temi inkubacijskimi pogoji. Poleg tega štetje kolonij ne registrira mrtvih celic, kar je pomembno vprašanje, ko potrebujete koncentracijo celic v prvotnem vzorcu.