Vsebina
- Kako delujejo encimi
- Kemikalije, ki pomagajo kemičnim reakcijam: kofaktorji
- Kemikalije, ki pomagajo kemičnim reakcijam: substrati
- Hitrejše reakcijske stopnje
Vsak trilijon celic vašega telesa je odvisen od tisoč kemičnih reakcij. Kemične reakcije v telesu se lahko odvijajo v epruveti, vendar se zgodijo veliko počasneje - prepočasi, da bi podprli aktivnosti živega organizma.
Encimi so beljakovine znotraj živih organizmov, ki pomagajo skupaj s kemičnimi reakcijami. Na njihovo sposobnost delovanja in hitrost, s katero delata, vpliva več dejavnikov. Nekateri izmed teh dejavnikov so tudi druge kemikalije.
Kako delujejo encimi
Kemične reakcije vključujejo pretrganje in tvorbo vezi med atomi. Prekinjenje vezi začetnih kemikalij - reaktantov - jemlje energijo. To se imenuje aktivacijska energija. Encimi so beljakovine, ki se zgrabijo na reaktante in jih usmerijo tako, da je energija aktivacije nižja. Reaktante imenujemo tudi substrati.
Encim veže substrate na določenih mestih, imenovanih aktivna mesta. Aktivna mesta so oblikovana tako, da omogočajo pritrditev na določene podlage. Vezani encimsko-substratni kompleks reaktantom lažje prekine vezi in tvori nove v izdelku.
Nato se izdelek sprosti iz encima.
Kemikalije, ki pomagajo kemičnim reakcijam: kofaktorji
Oblika aktivnega mesta je tisto, kar omogoča delo encimov. Če je aktivno mesto popačeno, se substrat ne veže in reakcija ne bo pomagala skupaj. Nekateri encimi potrebujejo vrste kemikalij, ki jih imenujemo kofaktorji, da dobijo pravilno obliko.
Kofaktorji so lahko v obliki anorganskih atomov ali organskih molekul. Primeri kofaktorjev vključujejo ioniziran cink atom - tisti, ki je izgubil par elektronov -, ki je nujen v encimu alkohol dehidrogenaza, ki se uporablja za presnovo alkohola.
Molekul nikotinamid adenin dinukleotid je običajen organski molekularni kofaktor in se imenuje tudi koencim. Pogosto sodeluje v reakcijah, ki zahtevajo prenos vodikovih atomov ali ionov. Koencimi in anorganski kofaktorji bodo morda potrebni, da encim deluje, in če jih ni dovolj, bo skupna hitrost reakcije počasna.
Kemikalije, ki pomagajo kemičnim reakcijam: substrati
Vsak encim ima eno posebno funkcijo. Encima, ki razdeli molekulo fruktoze na dva dela, ni mogoče uporabiti za sproščanje kisika iz rdečih krvnih celic. Da se reakcija zgodi, morata biti prisotna tako encim kot substrat. Hitrost reakcije je lahko omejena s pomanjkanjem encima ali substrata.
Povedano drugače, če je v celici veliko substrata in premalo encima, bo dodajanje več encima povečalo hitrost reakcije. Nasprotno, če je veliko encima in premalo substrata, bo dodajanje substrata povečalo hitrost reakcije. Vendar dodajanje več substrata, ko je veliko substrata in premalo encima (ali dodajanje več encima v nasprotni situaciji), ne bo povečalo hitrosti reakcije.
Hitrejše reakcijske stopnje
Dejanska hitrost encimsko katalizirane reakcije se ne spreminja. To pomeni, da je čas od vezave substrata do sproščanja izdelka enak za vsako določeno vrsto encima. Ko govorimo o pospešitvi delovanja encima, pomeni povečanje števila encimov, ki aktivno sodelujejo v kemičnih reakcijah, tako da se skupno število reakcij poveča.
Če na primer ni dovolj cinka, da bi se lahko ujemal z vsemi posebnimi vrstami encima za predelavo DNK v celici, bo dodajanje več cinka povečalo hitrost reakcije, tako da bo omogočilo, da bo več encimov aktivnih.
Enako je z dodajanjem več substrata ali več encima: Ukrep se pospeši tako, da več encimov katalizira kemične reakcije, ne pa s pospešitvijo katerega koli posameznega encima.