Vsebina
- Proizvodnja beljakovin iz aminokislin
- Peptidna vez med aminokislinami
- Stranske verige aminokislin
- Naročilo aminokislin in zvijanje beljakovin
- Stranske verige in zložljivi
- Število kombinacij aminokislin
Dolge verige aminokislin ali polimerov aminokislin se imenujejo beljakovine (čeprav beljakovine ne smejo biti izključno aminokisline). Aminokisline so povezane s tistimi, kar so "peptidne vezi". Vrstni red aminokislin je določen z vrstnim redom nukleotidov (genska "abeceda") v genu DNK, kar pa določa, kako se beljakovina zloži in deluje.
Proizvodnja beljakovin iz aminokislin
Proces povezovanja aminokislin z beljakovinami se začne v celičnem jedru. Messenger RNA (mRNA) za gen nastane z uporabo razteza DNK kot predloge. Nato mRNA potuje zunaj jedra k proizvajalcem beljakovin, imenovanih „ribosomi.“ Tu nastane protein. V ribosomih prenos RNA (tRNA) nato nalepi aminokisline na mRNA. V bistvu se mRNA uporablja kot predloga za gradnjo beljakovin.
Peptidna vez med aminokislinami
Aminokisline se v dolgih linearnih polimerih povezujejo od glave do repa. Konkretno, skupina karboksilne kisline (-CO) ene aminokisline se veže na amino skupino (-NH) naslednje. Ta vez se imenuje "peptidna vez". Take verige aminokislin se imenujejo "polipeptidi."
Stranske verige aminokislin
Aminokisline imajo stranske verige, pritrjene na centralni ogljikov atom. Te stranske verige imajo različne elektrostatične (vezivne) lastnosti. To je pomembno pri tem, kako se prvotno linearni protein zbriše, ko se sprosti iz svoje mRNA predloge.
Naročilo aminokislin in zvijanje beljakovin
Oblika proteina je določena z zaporedjem aminokislin. Vezi v dolgi polipeptidni verigi omogočajo prosto vrtenje atomov, kar daje hrbtenici beljakovine veliko prožnost. Večina polipeptidnih verig pa se zloži v samo eno obliko in večina to stori spontano.
Stranske verige in zložljivi
Zlaganje je določeno po vrstnem redu stranskih verig aminokislin. Te stranske verige delujejo med seboj in vodo v celici. Polarne stranske verige se ponavadi zvijejo proti vodi. Nepolarne stranske verige se spremenijo v središče beljakovinske kroglice in so hidrofobne (ne marajo vode). Porazdelitev polarnih in nepolarnih mest je zato eden najpomembnejših dejavnikov, ki urejajo zlaganje beljakovin.
Število kombinacij aminokislin
Za izdelavo beljakovin se uporablja 20 aminokislin. Medtem ko obstaja 20 ^ n različnih polipeptidov, ki so dolgi n aminokislin, bi bil zelo majhen del nastalih beljakovin stabilen. Večina bi imela številne oblike s skoraj enakovrednimi nivoji energije. Če bi lažje spremenili obliko in sprejeli drugačno raven energije, zato ne bi bili dovolj stabilni, da bi bili koristni za organizem. Ena aminokislina na napačnem mestu lahko torej povzroči, da so beljakovine neuporabne. Zato večina mutacij v DNK ne koristi organizmu. Le z ogromno količino poskusov in napak so se razvili koristni beljakovine.