Vsebina
- Splošna ekstrakcija DNK
- Rastlinske in živalske celice
- Ekstrakcija rastlinske DNA
- Ekstrakcija DNK živali
- Razlike v DNK
Struktura dvoverižne DNK je univerzalna v vseh živih celicah, vendar obstajajo razlike v metodah ekstrakcije genomske DNK iz živalskih in rastlinskih celic. Čeprav genomska DNK živi v jedru celic, sta količina in čistost ekstrahirane DNK odvisna od vrste in velikosti celice. Na primer, nekatere celice vsebujejo več DNK in nečistoč kot druge. Preberite več, če želite izvedeti več o razlikah v ekstrakciji DNK.
Splošna ekstrakcija DNK
Če rastlinske in živalske celice zdravite z milno snovjo, bo ta razgradila lipide v celičnih in jedrskih membranah. Nato se bo zmes DNK ločila od celičnih membran in beljakovin. Nato lahko uporabite alkohol za oborino DNK v raztopini. Glede na količino vzorca je lahko DNK vidna s prostim očesom. Vendar ne pozabite, da ta preprost postopek ne prinaša nujno visoke čistosti DNK.
Rastlinske in živalske celice
Rastlinske celice se razlikujejo od živalskih celic zaradi svoje toge celične stene in organelov, kot je kloroplast. Vsebujejo tudi beljakovine in encime, ki igrajo vlogo pri fotosintezi. Nekatere rastlinske celice imajo poliploidijo, kar pomeni, da imajo več kopij vsakega kromosoma na celico. Poleg tega celični procesi, ki se pojavljajo v rastlinah, kot je fotosinteza, proizvajajo vrsto sekundarnih presnovkov. Živalske celice nimajo celične stene, vendar še vedno potrebujejo kemikalije, kot je natrijev dodecil sulfat (SDS), da porušijo celično membrano, da sprostijo genomsko DNK.
Ekstrakcija rastlinske DNA
Rastlinsko genomsko DNK je težje ekstrahirati zaradi rastlinske celične stene. Odstranite ga lahko s homogenizacijo ali z dodatkom celuloze, da razgradite celulozo, ki tvori celično steno. Poleg tega lahko presnovki, prisotni v rastlinski celici, motijo ekstrakcijo genomske DNK s kontaminacijo vzorca DNK med postopkom obarjanja.
Ekstrakcija DNK živali
Periferni levkociti v krvi so glavni vir živalske genomske DNK, vendar je odvzem vzorcev težaven, ker mora krv prihajati neposredno iz živali. Kri vsebuje vrsto spojin, kot so beljakovine, lipidi, bele krvne celice, rdeče krvne celice, trombociti in plazma, ki lahko kontaminirajo vzorec DNK. Vendar je glavni onesnaževalec živalske DNK, ki se odvzame iz vzorcev krvi, heme, ki je neproteinska komponenta hemoglobina.
Razlike v DNK
Razlike med rastlinsko in živalsko DNK so v zaporedju baz v vijačnici. Spojine, ki jih najdemo v rastlinskih celicah, v živalskih celicah niso, in DNK bazne sekvence to odražajo. Tudi genomska rastlinska DNK je pogosto večja od živalske DNK. Te razlike vplivajo tudi na metode ekstrakcije, izkoristek in čistost DNK.