Vsebina
Ribonukleinska kislina ali RNA ima v življenju celice več vitalnih vlog. Deluje kot glasnik in prenaša genetski kod iz deoksiribonukleinske kisline ali DNK na mehanizem za sintezo beljakovin v celici. Ribosomalna RNA se združuje z beljakovinami in tvori ribosome, tovarne beljakovin v celici. Prenesite RNA aminokisline v rastoče beljakovinske verige, saj ribosomi prevajajo messenger RNA. Druge oblike RNA pomagajo nadzorovati aktivnost celic. Encima polimeraza RNA ali RNAP, ki ima več oblik, je odgovoren za podaljšanje verige RNA med prepisovanjem DNK.
RNA polimerazna struktura
V evkariontskih celicah - to je celicah z organiziranimi jedri - so različni tipi RNAP označeni od I do V. Vsaka ima nekoliko drugačno strukturo in vsaka ustvari drugačen nabor RNK. Na primer, RNAP II je odgovoren za ustvarjanje RNA messengerja ali mRNA. Prokariontske celice (ki nimajo organiziranih jeder) imajo eno vrsto RNAP. Encim je sestavljen iz več beljakovinskih podenot, ki med prepisovanjem opravljajo različne funkcije. Aktivno mesto, ki vsebuje atom magnezija, je lokacija znotraj encima, pri katerem se RNA razteza. Aktivno mesto dodaja sladkorno-fosfatne skupine v naraščajoči sklop RNA in veže nukleotidne baze v skladu s pravili združevanja baz.
Osnovno seznanjanje
DNK je dolga molekula s hrbtenico, sestavljena iz izmeničnih enot sladkorja in fosfata. Ena od štirih nukleotidnih baz - molekule z enim ali dvojnim obročem, ki vsebujejo dušik, visi iz vsake enote sladkorja. Štiri baze DNA so označene z A, T, C in G. Zaporedje baznih parov vzdolž molekule DNA narekuje zaporedje aminokislin v proteinih, ki jih celica sintetizira. DNK običajno obstaja kot dvojna vijačnica, v kateri se baze dveh pramenov vežejo drug na drugega po pravilih razdelitve baz: A in T baze tvorita en niz parov, C in G pa drugi sklop. RNA je sorodna enoverična molekula, ki med prepisovanjem DNA upošteva enaka pravila združevanja baz, razen pri zamenjavi baze U z T v RNA.
Začetek transkripcije
Faktorji iniciacije proteina morajo tvoriti kompleks z molekulo polimeraze RNA, preden se lahko začne prepisovati. Ti dejavniki omogočajo, da se encim veže na promocijske regije - pritrdilne točke za različne transkripcijske enote - na verigi DNA. Transkripcijske enote so sekvence enega ali več genov, ki so beljakovinsko specifični deli verige DNA. Kompleks polimeraze RNA ustvarja transkripcijski mehurček, tako da na začetku transkripcijske enote odtegnete del dvojne vijačnice DNA. Encimski kompleks nato začne sestavljati RNA tako, da bere predlogo DNA predloge eno bazo.
Raztezanje in prenehanje
Kompleks polimeraze RNA lahko povzroči veliko napačnih začetkov, preden se začne elongacija. Pri napačnem zagonu encim prepisuje približno 10 baz, nato postopek prekine in ponovno zažene. Podaljševanje se lahko začne šele, ko RNAP sprosti faktorje začetnih beljakovin, ki jih pritrdijo na regijo promotorja DNK. Ko poteka raztezanje, encim navaja dejavnike raztezanja, ki pomagajo premikati mehurček za prepisovanje po verigi DNK. Gibljiva molekula RNAP razteza novo verigo RNA z dodajanjem sladkorno-fosfatnih enot in nukleotidnih baz, ki dopolnjujejo baze na šabloni DNK. Če RNAP odkrije napačno seznanjeno bazo, lahko cepi in ponovno sintetizira napačni segment RNA. Transkripcija se konča, ko encim prebere zaporedje zaustavitve na šabloni DNK. Po prenehanju encim RNAP sprosti transkript RNA, beljakovinske dejavnike in predlogo DNK.